微生物是土壤生態(tài)系統(tǒng)的核心，是植物生態(tài)系統(tǒng)物質交換的主要媒介。微生物—植物互作的研究，可以為微生物肥料開發(fā)中菌種的選擇及提高微生物肥料應用效果提供理論指導。

生物中心農業(yè)微生物課題組和農業(yè)資源與經濟研究所微生物課題組開展合作攻關，利用利用一些功能微生物將畜禽糞便、酒糟、醋糟、菌糠和秸稈等農業(yè)廢棄物循環(huán)利用，發(fā)酵成優(yōu)質微生物有機肥，將適合的載體與抑病促生功能菌群施入土壤中來調節(jié)土壤微生物群落，以達到促生增產的目的。課題組成員趙佳博士于2018年1月和2月連續(xù)在國際期刊 《Acta Physiologiae Plantarum》 和 《Plos one》上發(fā)表題為“The rhizosphere microbial community response to a bio-organic fertilizer: fnding the mechanisms behind the suppression of watermelon Fusarium wilt disease”和“Manipulation of the rhizosphere microbial community through application of a new bioorganic fertilizer improves watermelon quality and health”的論文。